Пусть Господь Иисус Христос будет с твоим духом

"Молюсь, чтобы Господь укрепил твой дух".

Благодать с вами

"Молюсь, чтобы Господь явил всем вам Свою благодать" ("вам" - то есть Тимофею и всем верующим) (см. rc://*/ta/man/translate/figs-you).